解讀復活節兔子代表該物種基因組標準的芬蘭東部棕兔
東芬蘭大學環境與生物科學系的野兔研究小組發表了歐洲棕兔染色體組裝的參考基因組。參考基因組代表了物種基因組的一種標準,可以將物種的任何基因組數據與之進行比較。
傳統上,組裝參考基因組非常困難,因為它們需要構建染色體的細胞遺傳學和連鎖圖譜,這就是為什么它們僅適用于人類和一些用于研究的眾所周知的模式生物。
然而,最近的技術進步使得新方法能夠重建染色體結構并鑒定其基因內容。本研究還利用這些方法對來自芬蘭東部利佩里的一只棕色雄性野兔的參考基因組進行了測序和組裝。基因組由 29 億個堿基對組成,形成 23 條常染色體以及 X 和 Y 性染色體。總共鑒定了 30,833 個基因,其中 21,467 個是蛋白質編碼基因。相比之下,人類基因組稍大(31 億個堿基),但蛋白質編碼基因較少(20,080 個)。
棕色野兔代表了歐洲參考基因組圖譜計劃中芬蘭物種的第一個基因組,該計劃旨在為所有歐洲真核物種生成參考基因組。
參考基因組能夠并促進未來對該物種的多種類型的研究,因為來自該物種的任何 DNA 序列數據都可以通過與參考基因組進行比較來快速識別。此外,研究人員可以尋找和識別基因組中任何有趣的部分,例如單個基因,并利用它們來計劃和進行研究。與目前正在準備的山兔參考基因組一起,褐兔基因組已經為進化史、生理適應和種群調查開辟了新的研究途徑。開放獲取的基因組數據和相關研究也將加速該領域的發展,產生新知識、實際應用和創新。
基因組發布的時機非常合適,因為棕色野兔也代表了歐洲民間傳說中熟悉的原始復活節兔子。雖然對于復活節兔子的起源和象征意義存在相互矛盾的說法,但早在起源于伊比利亞半島的兔子流行之前,棕色野兔就在歐洲大陸很常見。
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