單分子成像揭示癌癥相關染色質重塑的異常 DNA 結合動力學
新加坡國立大學 (NUS) 的生物物理化學家發現了一個以前隱藏的環境,它控制著 SWI/SNF 染色質重塑劑的細胞內組織和動態,SWI/SNF 染色質重塑劑是一類控制細胞內基因組訪問的重要蛋白質復合物。
該項研究成果發表在《自然通訊》雜志上。
通過揭示這種動態如何在與多種人類癌癥相關的重塑蛋白的突變變體中出現問題,本研究得出的見解可能成為這些癌癥相關重塑突變的一組獨特而有價值的定量特征。
染色質重塑蛋白在調節 DNA(DNA 在細胞內被包裝成染色質)的獲取方面發揮著關鍵作用,從而允許其他 DNA 相互作用過程發生。盡管已知 SWI/SNF 重塑蛋白亞家族中的突變與超過 20% 的人類癌癥有關,但這些突變如何破壞它們與 DNA 的相互作用并最終導致癌癥,在定量方面仍不清楚。
由新加坡國立大學化學系和生物成像科學中心助理教授趙子清(Ziqing Winston Zhao)領導的研究小組首次采用先進的單分子成像方法,量化活體人類細胞中完全組裝的 SWI/SNF 重塑復合物的動態,解決了不同時間尺度上細胞內運動和 DNA 結合的不同模式。
為了更好地理解這種動態的空間組織,他們還設計了一種名為 STAR 的超分辨率映射策略,使他們能夠揭示細胞核中的許多納米級“熱點”,多個較長壽命的 DNA 結合事件優先聚集在這些“熱點”上,最終導致這些部位持續有效的染色質重塑。
最后,通過系統地比較不同腫瘤類型中不同癌癥涉及的各種重塑突變體,研究小組確定了每種突變體獨有的 DNA 結合動力學的多模式變化。
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