??QIIME 2 16S擴增子分析基礎流程及常用命令?
微生物組研究中，QIIME 2 是一款強大的工具！??以下是新手也能輕松上手的基礎流程和實用命令。??
首先，安裝 QIIME 2 并導入數據 ??：
```bash
conda install -c conda-forge qiime2=2023.4
qiime tools import --type 'SampleData[SequencesWithQuality]' --input-path demux.qza --output-path demux.qza
```
接著，進行質量控制 ??：
```bash
qiime quality-filter q-score --i-demultiplexed-sequences demux.qza --o-filtered-sequences filtered.qza
```
然后，對序列聚類并分類鑒定 ??：
```bash
qiime vsearch cluster-features-de-novo --i-sequences filtered.qza --p-perc-identity 0.97 --o-clustered-table table.qza
qiime feature-classifier classify-sklearn --i-classifier classifier.qza --i-reads table.qza --o-classification taxonomy.qza
```
最后，可視化結果 ??：
```bash
qiime tools export --input-path taxonomy.qza --output-path taxonomy_export
```
掌握這些基礎步驟，你就能開始探索微生物世界的奧秘啦！?? 微生物組 QIIME2 16S擴增子
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