調節衰老聚糖時鐘的基因網絡圖譜
一篇新的研究論文發表在《Aging》(被 MEDLINE/PubMed 列為“Aging (Albany NY)”和 Web of Science 的“Aging-US”)第15 卷第 24 期,標題為: “繪制調節衰老聚糖時鐘的基因網絡。”
聚糖是免疫球蛋白 G (IgG) 的重要結構成分,可調節其結構和功能。然而,這種復雜的翻譯后修飾背后的調控機制尚不清楚。之前的全基因組關聯研究 (GWAS) 鑒定了 29 個參與 IgG 糖基化調節的基因組區域,但只有少數得到了功能驗證。IgG 糖基化的關鍵功能特征之一是添加半乳糖(半乳糖基化),這一特征已被證明與衰老相關。
在這項新研究中,研究人員Azra Frkatovi?-Hod?i?、Anika Mijakovac、Karlo Miškec、Arina Nostaeva、Sodbo Z. Sharapov、Arianna Landini、Toomas Haller、Erik van den Akker、Sapna Sharma、Rafael RC Cua??drat、Massimo Mangino、Yong Li、Toma凱瑟、納吉達·魯德曼、塔瑪拉·斯塔姆布克、瑪雅·普契奇-巴科維奇、伊雷娜·特爾博耶維奇-阿克馬契奇、伊萬·古德爾吉、耶科·斯塔姆布克、蒂亞·普里比奇、芭芭拉·拉多瓦尼、佩特拉·托米納克、克里斯塔·費舍爾、瑪麗安·比克曼、曼弗雷德·伍爾、克里斯蒂安·吉格、馬蒂亞斯·B·舒爾茨、來自 Genos 糖科學研究實驗室的 Clemens Wittenbecher、Ozren Polasek、Caroline Hayward、James F. Wilson、Tim D. Spector、Anna Köttgen、Frano Vu?kovi?、Yurii S. Aulchenko、Aleksandar Vojta、Jasminka Krišti?、Lucija Klari?、Vlatka Zoldoš 和 Gordan Lauc (來自Genos 糖科學研究實驗室) ,薩格勒布大學,新西伯利亞國立大學,莫斯科國立羅蒙諾索夫大學,愛丁堡大學, 塔爾圖大學,萊頓大學醫學中心,代爾夫特理工大學,慕尼黑亥姆霍茲中心,德國糖尿病研究中心 (DZD) ,倫敦國王學院,蓋伊大學和圣托馬斯基金會信托基金、弗萊堡大學、里耶卡大學、德國人類營養研究所波茨坦-雷布呂克、波茨坦大學、哈佛大學陳曾熙公共衛生學院、查爾姆斯理工大學、斯普利特大學醫學院、代數大學學院、約翰·霍普金斯大學彭博公共衛生學院和SB RAS 細胞學與遺傳學研究所對 IgG 半乳糖基化 (N=13,705) 進行了 GWAS,并鑒定了 16 個顯著相關的位點,表明 IgG 半乳糖基化受到復雜的基因網絡的調節,該網絡超出了將半乳糖添加到 IgG 聚糖上的半乳糖基轉移酶。
“在這里,我們在一項研究中進行了 IgG 半乳糖基化表型的 GWAS,與之前的 IgG N-糖基化 GWAS 相比,樣本量幾乎增加了一倍 (N=13,705) [ 33 ],并重點關注具有計算機模擬證據的基因參與IgG 半乳糖基化過程。”
基因優先排序確定了 37 個候選基因。利用最近開發的 CRISPR/dCas9 系統,研究人員操縱了體外IgG 表達系統中候選基因的基因表達。EEF1A1、MANBA 和 TNFRSF13B 三個基因的上調改變了 IgG 糖組的組成,這證實了這三個基因參與了該體外表達系統中的 IgG 半乳糖基化。
“需要進一步的研究來充分闡明它們在衰老中的作用背后的功能機制,并揭示調節 IgG 糖基化復雜過程的基因相互作用的完整網絡。”
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